以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
演员：本多知惠子 坂本千夏 折笠爱 兴梠里美 小野健一 玉川纱己子 京田尚子 西村知道 佐藤智惠 三石琴乃 矢岛晶子 盐屋浩三 长岛雄一 辻谷耕史 池本小百合 铃置洋孝
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演员：麦人 中村悠一 丰崎爱生 市之濑加那 川澄绫子 广濑裕也 田中理惠 沼仓爱美 日笠阳子 古川慎 柳田淳一 山本兼平 相马康一 前野智昭 河西健吾 佐藤元 小林裕介 上田丽奈 Lynn 村濑步 山本格 内匠靖明 高桥花林 高野麻里佳 前田弘喜
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